本奖每二年举办一次,为鼓励学术界与产业界之交流合作,促进科技应用,本会针对国内各大专院校、育成中心或研究机构之教师及研究员,符合特定主题所开发出的产品或技术,已申请发明专利者予以奖励,得奖者可获奖座乙座及奖金新台币二○万元。评选主题分为三类,分别为「奈米科技类」、「通讯光电类」、「生技医药类」,每类一名,共计三名。
「第三届有庠科技发明奖」新增「绿色科技」类别,凡运用科技足以对环境污染防治、环境生物保育、环境永续资源,或是节约能源、开发再生能源、以及其它对环境与能源之使用有所贡献之发明专利均可提出申请。